MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nocardia farcinica IFM 10152 plasmid pNF1

Total Repeats: 4082

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006362	GTT	2	6	16	21	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54027649
2	NC_006362	GGC	2	6	69	74	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027649
3	NC_006362	CAC	2	6	75	80	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027649
4	NC_006362	TC	3	6	116	121	0 %	50 %	0 %	50 %	54027649
5	NC_006362	GCG	2	6	127	132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027649
6	NC_006362	CAG	2	6	155	160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027649
7	NC_006362	TGG	2	6	163	168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027649
8	NC_006362	CA	3	6	209	214	50 %	0 %	0 %	50 %	54027649
9	NC_006362	GC	3	6	231	236	0 %	0 %	50 %	50 %	54027649
10	NC_006362	CAG	3	9	246	254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027649
11	NC_006362	AAGACG	2	12	296	307	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	54027649
12	NC_006362	AGC	2	6	312	317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027649
13	NC_006362	GC	3	6	357	362	0 %	0 %	50 %	50 %	54027649
14	NC_006362	TCA	2	6	449	454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027649
15	NC_006362	AAT	2	6	487	492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54027649
16	NC_006362	CG	3	6	597	602	0 %	0 %	50 %	50 %	54027649
17	NC_006362	GTG	2	6	622	627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027649
18	NC_006362	GCTC	2	8	681	688	0 %	25 %	25 %	50 %	54027649
19	NC_006362	GGCC	2	8	716	723	0 %	0 %	50 %	50 %	54027650
20	NC_006362	CG	3	6	732	737	0 %	0 %	50 %	50 %	54027650
21	NC_006362	GAA	2	6	767	772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54027650
22	NC_006362	CG	3	6	794	799	0 %	0 %	50 %	50 %	54027650
23	NC_006362	GACC	2	8	820	827	25 %	0 %	25 %	50 %	54027650
24	NC_006362	CG	3	6	898	903	0 %	0 %	50 %	50 %	54027650
25	NC_006362	TGGACG	2	12	910	921	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	54027650
26	NC_006362	TCG	2	6	934	939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027650
27	NC_006362	ATC	2	6	963	968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027650
28	NC_006362	AG	3	6	972	977	50 %	0 %	50 %	0 %	54027650
29	NC_006362	CGT	2	6	1031	1036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027650
30	NC_006362	CGAG	2	8	1125	1132	25 %	0 %	50 %	25 %	54027650
31	NC_006362	GCGG	2	8	1136	1143	0 %	0 %	75 %	25 %	54027650
32	NC_006362	CATC	2	8	1144	1151	25 %	25 %	0 %	50 %	54027650
33	NC_006362	CGG	2	6	1287	1292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027650
34	NC_006362	CCG	2	6	1381	1386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027650
35	NC_006362	GAA	2	6	1421	1426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54027650
36	NC_006362	CTC	2	6	1463	1468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027650
37	NC_006362	GTG	2	6	1570	1575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027650
38	NC_006362	AGC	2	6	1591	1596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027650
39	NC_006362	AGT	2	6	1627	1632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027650
40	NC_006362	GC	4	8	2109	2116	0 %	0 %	50 %	50 %	54027651
41	NC_006362	CGG	2	6	2213	2218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027651
42	NC_006362	TG	3	6	2256	2261	0 %	50 %	50 %	0 %	54027651
43	NC_006362	CGG	2	6	2262	2267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027651
44	NC_006362	GCG	2	6	2295	2300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027651
45	NC_006362	TGC	2	6	2355	2360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027651
46	NC_006362	G	6	6	2361	2366	0 %	0 %	100 %	0 %	54027651
47	NC_006362	AGG	2	6	2408	2413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027651
48	NC_006362	CGGT	3	12	2421	2432	0 %	25 %	50 %	25 %	54027651
49	NC_006362	GAC	2	6	2434	2439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027651
50	NC_006362	GCG	2	6	2468	2473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027651
51	NC_006362	GTC	2	6	2491	2496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027651
52	NC_006362	GCA	2	6	2498	2503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027651
53	NC_006362	GAA	2	6	2505	2510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54027651
54	NC_006362	GATC	2	8	2564	2571	25 %	25 %	25 %	25 %	54027651
55	NC_006362	CGG	2	6	2633	2638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027651
56	NC_006362	CAG	2	6	2737	2742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027651
57	NC_006362	GTG	2	6	2754	2759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027651
58	NC_006362	GGC	2	6	2814	2819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027651
59	NC_006362	GCC	2	6	2837	2842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027651
60	NC_006362	CGG	2	6	2880	2885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027651
61	NC_006362	GC	3	6	2947	2952	0 %	0 %	50 %	50 %	54027651
62	NC_006362	GGC	2	6	2985	2990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027652
63	NC_006362	AC	3	6	3023	3028	50 %	0 %	0 %	50 %	54027652
64	NC_006362	AGTG	2	8	3121	3128	25 %	25 %	50 %	0 %	54027652
65	NC_006362	GCG	3	9	3177	3185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027652
66	NC_006362	TGC	2	6	3307	3312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027652
67	NC_006362	CGT	2	6	3368	3373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027652
68	NC_006362	ACC	2	6	3451	3456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027652
69	NC_006362	CTTCCT	2	12	3458	3469	0 %	50 %	0 %	50 %	54027652
70	NC_006362	TG	3	6	3515	3520	0 %	50 %	50 %	0 %	54027652
71	NC_006362	CAG	3	9	3585	3593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027652
72	NC_006362	GCG	2	6	3595	3600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027652
73	NC_006362	GCG	2	6	3610	3615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027652
74	NC_006362	GGC	2	6	3641	3646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027652
75	NC_006362	CGT	2	6	3671	3676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027652
76	NC_006362	CGA	2	6	3677	3682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027652
77	NC_006362	GC	3	6	3694	3699	0 %	0 %	50 %	50 %	54027652
78	NC_006362	GCG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027652
79	NC_006362	CGA	2	6	3758	3763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027652
80	NC_006362	GCC	2	6	3793	3798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027652
81	NC_006362	GGT	2	6	3800	3805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027652
82	NC_006362	CGG	2	6	3840	3845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027652
83	NC_006362	GCG	2	6	3852	3857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027652
84	NC_006362	GGGC	2	8	3920	3927	0 %	0 %	75 %	25 %	54027652
85	NC_006362	GCG	2	6	3946	3951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027652
86	NC_006362	CCG	2	6	3975	3980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027652
87	NC_006362	GCGGTG	2	12	4021	4032	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	54027652
88	NC_006362	GCG	2	6	4076	4081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027652
89	NC_006362	GCC	3	9	4177	4185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027652
90	NC_006362	AGC	2	6	4426	4431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027653
91	NC_006362	CCGG	3	12	4457	4468	0 %	0 %	50 %	50 %	54027653
92	NC_006362	AC	3	6	4472	4477	50 %	0 %	0 %	50 %	54027653
93	NC_006362	GTC	2	6	4551	4556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027653
94	NC_006362	CCCGAC	2	12	4566	4577	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	54027653
95	NC_006362	GCC	2	6	4628	4633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027653
96	NC_006362	GCA	2	6	4634	4639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027653
97	NC_006362	CGG	2	6	4673	4678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027653
98	NC_006362	GCT	2	6	4751	4756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027653
99	NC_006362	AGG	2	6	4777	4782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027653
100	NC_006362	CTC	2	6	4791	4796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027653
101	NC_006362	ACC	2	6	4804	4809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027653
102	NC_006362	CCG	3	9	4810	4818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027653
103	NC_006362	TCGG	2	8	5012	5019	0 %	25 %	50 %	25 %	54027654
104	NC_006362	AG	3	6	5020	5025	50 %	0 %	50 %	0 %	54027654
105	NC_006362	CG	3	6	5082	5087	0 %	0 %	50 %	50 %	54027654
106	NC_006362	TTC	2	6	5090	5095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54027654
107	NC_006362	GGC	2	6	5104	5109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027654
108	NC_006362	GCA	2	6	5139	5144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027654
109	NC_006362	GGT	2	6	5152	5157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027654
110	NC_006362	CGC	2	6	5169	5174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027654
111	NC_006362	ATCGGC	2	12	5222	5233	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	54027654
112	NC_006362	GTC	2	6	5254	5259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027654
113	NC_006362	GTC	2	6	5279	5284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027654
114	NC_006362	GCT	2	6	5290	5295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027654
115	NC_006362	TCG	2	6	5302	5307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027654
116	NC_006362	CG	3	6	5317	5322	0 %	0 %	50 %	50 %	54027654
117	NC_006362	GGC	2	6	5325	5330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027654
118	NC_006362	GCCG	2	8	5331	5338	0 %	0 %	50 %	50 %	54027654
119	NC_006362	TGGTG	2	10	5343	5352	0 %	40 %	60 %	0 %	54027654
120	NC_006362	GTC	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027654
121	NC_006362	GGC	2	6	5374	5379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027654
122	NC_006362	GCGG	2	8	5461	5468	0 %	0 %	75 %	25 %	54027654
123	NC_006362	GC	3	6	5487	5492	0 %	0 %	50 %	50 %	54027654
124	NC_006362	CGG	2	6	5526	5531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027654
125	NC_006362	TGG	2	6	5622	5627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027654
126	NC_006362	GCG	2	6	5663	5668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027654
127	NC_006362	GGA	2	6	6001	6006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027655
128	NC_006362	CGC	2	6	6041	6046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027655
129	NC_006362	CGA	2	6	6060	6065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027655
130	NC_006362	TCG	2	6	6119	6124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027655
131	NC_006362	TCG	2	6	6200	6205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027655
132	NC_006362	TCG	2	6	6209	6214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027655
133	NC_006362	GCCG	2	8	6230	6237	0 %	0 %	50 %	50 %	54027655
134	NC_006362	GGC	2	6	6241	6246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027655
135	NC_006362	TCG	2	6	6275	6280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027655
136	NC_006362	CGGGG	2	10	6292	6301	0 %	0 %	80 %	20 %	54027655
137	NC_006362	GTT	2	6	6327	6332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54027655
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264	NC_006362	CCT	2	6	11353	11358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027661
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268	NC_006362	GCC	2	6	11560	11565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027661
269	NC_006362	GCG	3	9	11587	11595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027661
270	NC_006362	GC	3	6	11612	11617	0 %	0 %	50 %	50 %	54027661
271	NC_006362	CCACGC	2	12	11675	11686	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	54027661
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276	NC_006362	GA	3	6	11860	11865	50 %	0 %	50 %	0 %	54027661
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280	NC_006362	CGA	2	6	11998	12003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027662
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282	NC_006362	GCG	3	9	12084	12092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027662
283	NC_006362	CGA	2	6	12154	12159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027663
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285	NC_006362	CGC	2	6	12214	12219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027663
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292	NC_006362	CGG	2	6	12412	12417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027663
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299	NC_006362	GC	3	6	12655	12660	0 %	0 %	50 %	50 %	54027664
300	NC_006362	GTG	2	6	12673	12678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027664
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302	NC_006362	CGG	2	6	12788	12793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027664
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380	NC_006362	ACC	2	6	15522	15527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027666
381	NC_006362	GAG	2	6	15551	15556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027666
382	NC_006362	TGC	2	6	15684	15689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027666
383	NC_006362	CGA	2	6	15727	15732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027666
384	NC_006362	GCCG	2	8	15749	15756	0 %	0 %	50 %	50 %	54027666
385	NC_006362	CGC	2	6	15767	15772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027666
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390	NC_006362	TCG	2	6	15980	15985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027666
391	NC_006362	GAG	2	6	15995	16000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027666
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394	NC_006362	GCG	2	6	16067	16072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027666
395	NC_006362	GAG	2	6	16094	16099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027666
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397	NC_006362	CGT	2	6	16128	16133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027666
398	NC_006362	CCGA	2	8	16142	16149	25 %	0 %	25 %	50 %	54027666
399	NC_006362	GCG	3	9	16150	16158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027666
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